Από τη Wikipedia: Στη σύγχρονη εποχή, η ιστορία είναι για τον Miharu Rokujou, ο οποίος ήθελε απλώς να ζήσει μια κανονική ζωή και να κληρονομήσει ένα εστιατόριο Okonomiyaki. Προς το παρόν, το μεγαλύτερο πρόβλημά του ήταν η συνεχής παρενόχληση από τους Kouichi Aizawa και Durandal Thobari Kumohira, οι οποίοι ξεκίνησαν ένα Nindō (忍道?, φωτ. «Way of the Ninja») Club. Ο Μιχάρου δεν ήθελε να έχει καμία σχέση με «νίντζα» και τους απορρίπτει κάθε φορά. Αλλά σύντομα, δέχεται επίθεση από μια πραγματική ομάδα νίντζα και προστατεύεται από τον Kouichi και την Kumohira. Εκεί, ο Miharu μαθαίνει για τον κρυμμένο κόσμο των νίντζα Nabari, τους ρόλους του συμμαθητή και του δασκάλου του σε αυτόν τον κόσμο, και για τη μυστική τέχνη Shinra Banshou (森羅万象 Shinrabanshō?, δηλ. «όλα τα πράγματα στη φύση») μέσα του. Η μυστική τέχνη, που περιέχει όλη τη γνώση του κόσμου, είναι πολύ περιζήτητη στο Nabari. Και εξαιτίας αυτού, ο Miharu δεν μπορεί να επιστρέψει στην κανονική του ζωή. Πρέπει να γίνει ο «Κυβερνήτης του Ναμπάρι» για να επιβιώσει. Από το Baka-Updates: Ο Rokujou Miharu ήταν ένας φαινομενικά απρόθυμος μαθητής γυμνασίου που ζούσε στον δικό του κόσμο. Ωστόσο, μέσα του, κρυβόταν η απόλυτη δύναμη του Nabari, του «Παντοδύναμου». Για να κατέχει ένα τέτοιο υπέρτατο όπλο, το Wolf Pack of Iga ορκίστηκε να φέρει τον Miharu πίσω στο χωριό Iga. Από την άλλη πλευρά, ο καθηγητής Αγγλικών του Miharu, Kumohira sensei, και ο συμμαθητής του, Kouichi, ήταν οι Banten ninja των οποίων η αποστολή ήταν να προστατεύσουν τον Miharu. Έτσι ξεκίνησε ένας πόλεμος για την ιδιοκτησία του «Παντοδύναμου». Για να επιβιώσει, ο Miharu πρέπει να μπει στον κρυφό κόσμο Nabari, για να γίνει ο βασιλιάς.
