Στο εγγύς μέλλον, ένας Ιάπωνας επιστήμονας κατασκευάζει έναν ηλεκτροκίνητο εξωσκελετό που ονομάζεται «Infinite Stratos» (IS). Διαθέτοντας τεχνολογία και ικανότητες μάχης πολύ πιο προηγμένες από οποιοδήποτε άλλο οπλικό σύστημα, το IS απειλεί να αποσταθεροποιήσει τον κόσμο. Αντιμέτωποι με ένα τόσο ισχυρό όπλο, τα έθνη του κόσμου θεσπίζουν τη «Συνθήκη της Αλάσκας», η οποία δηλώνει ότι το IS δεν θα χρησιμοποιηθεί ποτέ για στρατιωτικούς αγώνες και ότι η υπάρχουσα τεχνολογία του IS πρέπει να κατανεμηθεί ισότιμα σε όλα τα έθνη, για να αποτρέψει οποιοδήποτε έθνος να κυριαρχήσει οι άλλοι. Ωστόσο, η εισαγωγή του ΚτΠ έχει μεγάλη επίδραση στην κοινωνία. Καθώς το IS μπορεί να λειτουργήσει μόνο από γυναίκες, η ισορροπία ισχύος μεταξύ ανδρών και γυναικών έχει σπάσει, με τις γυναίκες να κυριαρχούν στην κοινωνία έναντι των ανδρών.
Δέκα χρόνια μετά την εισαγωγή του πρώτου IS, ο κόσμος έχει εισέλθει σε μια νέα εποχή ειρήνης. Η γαλήνη όμως κλονίζεται από μια απρόσμενη ανακάλυψη. Ένα 15χρονο αγόρι από την Ιάπωνα, ονόματι Ichika Orimura, ανακαλύπτεται ότι είναι ικανό να χειριστεί ένα IS. Συνειδητοποιώντας τις δυνατότητες, ο Ichika αναγκάζεται από την ιαπωνική κυβέρνηση να παρακολουθήσει το διάσημο Infinite Stratos Academy, μια διεθνή ακαδημία όπου εκπαιδεύονται πιλότοι του IS από όλο τον κόσμο. Έτσι ξεκινά η πολυάσχολη σχολική του ζωή περιτριγυρισμένος από κορίτσια.
